2013 január 1-től ismét átalakul a TÁMOP 5.2.1. kiemelt program konzorciumi összetétele. A konzorciumvezető Közigazgatási és Igazságügyi Hivatal (korábban Wekerle Sándor Alapkezelő) feladatait az Emberi Erőforrások Minisztériuma keretében működő Emberi Erőforrás Támogatáskezelő (EMET) veszi át. Az átalakulás az MTA TK feladatait nem érinti.